Comsol Multiphysics算法特點(diǎn)分析與高速計(jì)算設(shè)備(單機(jī)、集群)硬件配置選型
COMSOL Multiphysics是一款高性能的多物理場仿真軟件,廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究、工程設(shè)計(jì)和產(chǎn)品開發(fā)等領(lǐng)域,它能夠模擬和解決涉及多個(gè)物理現(xiàn)象相互作用的復(fù)雜問題。
(一)多物理場耦合仿真計(jì)算主要環(huán)節(jié):
1. 前處理(Preprocessing)
- 特點(diǎn):在這個(gè)階段,用戶定義問題的幾何形狀、材料屬性、邊界條件、初始條件以及物理場的設(shè)置。前處理是計(jì)算模擬的基礎(chǔ),確保模型正確反映了物理現(xiàn)象。
- 計(jì)算特點(diǎn):雖然這一步驟并不涉及到大量的數(shù)值計(jì)算,但它需要用戶有深入的物理理解和工程知識(shí),以確保模型的準(zhǔn)確性和合理性。
2. 網(wǎng)格生成(Meshing)
- 特點(diǎn):為了數(shù)值求解偏微分方程,必須將連續(xù)的幾何體離散化成有限數(shù)量的單元,即生成網(wǎng)格。網(wǎng)格質(zhì)量直接影響到計(jì)算結(jié)果的準(zhǔn)確性和計(jì)算效率。
- 計(jì)算特點(diǎn):網(wǎng)格生成涉及到算法選擇(如自由網(wǎng)格、映射網(wǎng)格、邊界層網(wǎng)格等),并且可能需要考慮局部細(xì)化以捕捉細(xì)節(jié)。高質(zhì)量的網(wǎng)格可以減少計(jì)算誤差,但也會(huì)增加計(jì)算資源的需求。
3. 求解(Solving)
- 特點(diǎn):在這個(gè)階段,COMSOL Multiphysics使用數(shù)值方法(如有限元法)求解所設(shè)定的物理方程。求解器的選擇(直接或迭代)取決于問題的性質(zhì)和規(guī)模。
- 計(jì)算特點(diǎn):直接求解器適用于小型到中型問題,迭代求解器更適合大型模型。計(jì)算時(shí)間、內(nèi)存消耗和收斂性是求解過程的關(guān)鍵考量因素。
4. 后處理(Postprocessing)
- 特點(diǎn):計(jì)算完成后,后處理階段用于可視化和分析計(jì)算結(jié)果,幫助理解物理現(xiàn)象和驗(yàn)證模型的有效性。
- 計(jì)算特點(diǎn):雖然后處理階段本身不涉及大量的計(jì)算,但它可能需要處理大量數(shù)據(jù)以生成圖形、動(dòng)畫或統(tǒng)計(jì)分析,這可能對存儲(chǔ)和讀取速度有一定要求。
5. 驗(yàn)證與確認(rèn)(Validation and Verification)
- 特點(diǎn):這個(gè)環(huán)節(jié)可能沒有明確的計(jì)算步驟,但它是一個(gè)重要的過程,用于確保模型和計(jì)算結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性。
- 計(jì)算特點(diǎn):這可能包括與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)對比、理論預(yù)測比較或使用不同的網(wǎng)格密度和求解器設(shè)置重復(fù)計(jì)算以評估模型的穩(wěn)健性。
6. 優(yōu)化與參數(shù)研究(Optimization and Parametric Studies)
- 特點(diǎn):在某些情況下,用戶可能希望優(yōu)化模型的某個(gè)方面或研究參數(shù)的變化對結(jié)果的影響。
- 計(jì)算特點(diǎn):這通常涉及多次運(yùn)行模型,可能需要使用設(shè)計(jì)空間探索工具或優(yōu)化算法,這會(huì)大大增加總體計(jì)算時(shí)間和資源需求。
整個(gè)計(jì)算流程從模型構(gòu)建開始,經(jīng)過網(wǎng)格劃分、求解、結(jié)果分析,到最后的驗(yàn)證和可能的優(yōu)化,每個(gè)環(huán)節(jié)都需要精心設(shè)計(jì)和執(zhí)行,以確保最終結(jié)果的準(zhǔn)確性和有效性。
(二)COMSOL主要應(yīng)用及算法、求解器
|
應(yīng)用場景 |
主要求解問題 |
相關(guān)求解器 |
1 |
結(jié)構(gòu)力學(xué) |
分析固體的應(yīng)力、應(yīng)變、振動(dòng)和穩(wěn)定性等問題 |
選用直接求解器如PARDISO或 迭代求解器如Conjugate Gradient (配以預(yù)處理器如ILU)。 |
2 |
流體力學(xué)(CFD) |
研究流體流動(dòng)、傳熱、混合和相變等現(xiàn)象 |
對于瞬態(tài)問題,常用迭代求解器如GMRES,并搭配AMG(代數(shù)多重網(wǎng)格)作為預(yù)處理器。 |
3 |
電磁學(xué) |
分析電磁場分布、電磁波傳播、天線設(shè)計(jì)等 |
使用迭代求解器如FGMRES,搭配SSOR或幾何多重網(wǎng)格作為預(yù)處理器 |
4 |
傳熱與流固耦合(FSI) |
研究熱量傳遞、熱傳導(dǎo)、對流及輻射,以及流體和固體結(jié)構(gòu)之間的相互作用 |
對于強(qiáng)耦合問題,可能采用完全耦合的求解器; 對于弱耦合問題,則可能使用分離式求解器。 |
5 |
聲學(xué) |
模擬聲波傳播、噪聲控制和振動(dòng)聲學(xué) |
迭代求解器配合相應(yīng)的預(yù)處理技術(shù) |
6 |
化學(xué)與反應(yīng)工程 |
研究物質(zhì)傳遞、化學(xué)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)等 |
針對這類非線性問題,迭代求解器如BiCGSTAB加上適當(dāng)?shù)念A(yù)處理器 |
7 |
微機(jī)電系統(tǒng)(MEMS) |
設(shè)計(jì)和分析微尺度設(shè)備的力學(xué)、電學(xué)和流體特性 |
使用特征值求解器來分析共振頻率,以及參數(shù)化求解器來探索設(shè)計(jì)參數(shù)的影響 |
COMSOL Multiphysics 提供多種求解器,它們針對不同類型的數(shù)學(xué)問題進(jìn)行了優(yōu)化,包括線性系統(tǒng)、非線性系統(tǒng)、瞬態(tài)分析和多物理場耦合問題。以下是一些主要的求解器類型及其計(jì)算特點(diǎn):
直接求解器
- UMFPACK 適用于一般非對稱矩陣,魯棒性和效率較高,但內(nèi)存占用大。
- SPOOLES 利用對稱矩陣特性,相比UMFPACK更有效使用內(nèi)存,但計(jì)算速度略慢。
- PARDISO 利用對稱矩陣特性,支持共享式并行計(jì)算,計(jì)算效率高,使用內(nèi)存較少,不需選主元節(jié)省內(nèi)存,但可能導(dǎo)致精度下降。
- MUMPS 大規(guī)模并行直接求解器,適用于大規(guī)模問題,支持分布式和共享內(nèi)存架構(gòu)。
迭代求解器
- GMRES (Generalized Minimal Residual) 通用迭代求解器,適用于非對稱線性系統(tǒng),需要預(yù)處理器以提高效率。
- BiCGSTAB (Biconjugate Gradient Stabilized) 適用于非對稱線性系統(tǒng),通常用于流體力學(xué)問題。
- PCG (Preconditioned Conjugate Gradient) 適用于對稱正定矩陣,如彈性力學(xué)問題。
- MINRES (Minimum Residual) 適用于對稱矩陣,即使矩陣不是正定的。
預(yù)處理器
- ILU (Incomplete LU Decomposition) 不完全LU分解,可作為迭代求解器的預(yù)處理器,加速收斂。
- AMG (Algebraic Multigrid) 代數(shù)多重網(wǎng)格方法,用于加速迭代求解器的收斂速度,特別適用于大規(guī)模問題。
其他求解器
- 特征值求解器 用于求解特征值問題,如模式分析。
- 域分解求解器 將問題分解為多個(gè)子域,在子域上分別求解,然后迭代耦合,適用于并行計(jì)算。
算法特點(diǎn)簡述:
- 直接求解器(如UMFPACK, PARDISO):提供精確解,適合小至中等規(guī)模問題,內(nèi)存消耗大,但計(jì)算效率高,適用于非對稱或特定對稱問題,計(jì)算時(shí)間相對短,但內(nèi)存需求大,適用于小型到中型模型或線性問題。
- 迭代求解器(如GMRES, FGMRES, CG):適用于大規(guī)模問題,內(nèi)存占用相對較小,但可能需要更多迭代次數(shù)才能收斂,通常需要預(yù)處理器(如AMG, ILU, Jacobi, SOR)來加速收斂。計(jì)算時(shí)間可能較長,適用于大型模型或非線性問題,尤其是當(dāng)配合有效的預(yù)處理器時(shí)
- 并行求解器:如PARDISO和MUMPS的并行版本,可以利用多核處理器或集群資源,顯著加快計(jì)算速度,適合大規(guī)模模型。
- 特征值求解器:用于求解系統(tǒng)的固有頻率或模態(tài)形狀,適用于振動(dòng)、穩(wěn)定性分析等。
- 參數(shù)化求解器:允許用戶按一系列參數(shù)值自動(dòng)運(yùn)行仿真,適合設(shè)計(jì)優(yōu)化和靈敏度分析。
- 分離式求解器(Stationary/Time dependent segregated):適用于弱耦合或多物理場問題,通過依次求解各個(gè)物理場,然后迭代耦合直至收斂,降低了內(nèi)存需求。
每種求解器和算法的選擇取決于具體問題的性質(zhì)(如線性/非線性、穩(wěn)態(tài)/瞬態(tài)、規(guī)模大小、耦合程度)、計(jì)算資源限制以及所需的精度與計(jì)算時(shí)間。COMSOL Multiphysics通常會(huì)根據(jù)模型特點(diǎn)自動(dòng)推薦求解器,用戶也可根據(jù)實(shí)際需求手動(dòng)調(diào)整求解設(shè)置。
(三)計(jì)算機(jī)硬件配置選型
應(yīng)用精度提升,計(jì)算規(guī)模越來越大,求解時(shí)間越來越長與自由度不斷增大,討論改變求解時(shí)間的計(jì)算機(jī)硬件配置
(1)CPU 高頻率+最新微架構(gòu)+大緩存
時(shí)鐘速度影響到軟件的各個(gè)方面,速度當(dāng)然是越快越好。從實(shí)用的角度來看,通常不可能簡單地只升級時(shí)鐘速度而保持其他東西不變,所以不可能隔離改進(jìn),
CPU緩存越大越好,但是緩存的大小與核的數(shù)量成正比,所以有最高緩存的 CPU會(huì)有很多的核,價(jià)格也相對昂貴。
CPU核數(shù) 不同應(yīng)用求解對核數(shù)有一個(gè)最佳值,還兼顧多并發(fā)計(jì)算應(yīng)用
在保持所有其他因素不變的情況下,升級到更多的內(nèi)核是很困難的。因此,確定更多內(nèi)核并不容易做到。在大多數(shù)情況下,當(dāng)求解一個(gè)單一的模型時(shí),每一個(gè)工作都使用超過 8 個(gè)內(nèi)核并沒有什么優(yōu)勢。如果求解時(shí)間是由直接線性求解器主導(dǎo)的,那么內(nèi)核更多則獲益更多。另一方面,非常小的模型可能在單核上求解得更快,即使有更多的核心可用。也就是說,對于較小的模型來說,并行化有一個(gè)重要的計(jì)算成本。
另外,在并行運(yùn)行多個(gè)工作時(shí),如使用 COMSOL Multiphysics 中的批處理功能時(shí),多核也是有優(yōu)勢的?,F(xiàn)在有些 CPU 同時(shí)提供 P 核和 E 核,這就需要額外進(jìn)行性能權(quán)衡。
雙CPU的圖形工作站
支持雙插槽操作的CPU,每個(gè)CPU有8個(gè)或12個(gè)內(nèi)存通道,總共有16個(gè)或24 個(gè)通道,因此這類系統(tǒng)256GB~1TB之間內(nèi)存,所以這些系統(tǒng)主要用于求解非常大的模型或許多模型的并行操作。
4 顆CPU的圖形工作站
這種架構(gòu),每個(gè)cpu有8個(gè)通道,總共有32個(gè)通道,僅考慮需要非常多的 RAM 內(nèi)存( 1TB~6TB)的模型。這些系統(tǒng)主要用于求解超大規(guī)模模型或許多模型的并行操作。
(2)內(nèi)存 大容量+內(nèi)存帶寬最大化
所有的內(nèi)存通道上均衡地添加內(nèi)存,就能提高使用虛擬內(nèi)存明顯多于物理內(nèi)存的模型的求解速度。例如,用于這些測試的 CPU 有8個(gè)或12個(gè)內(nèi)存通道,每個(gè)通道有一個(gè) 32GB/64G DIMM。全部插滿,這樣讀寫帶寬最大化,
同時(shí)也要保證內(nèi)存容量能裝下操作系統(tǒng)、程序、求解數(shù)據(jù),還有些冗余
升級到帶有更多內(nèi)存通道 CPU 的圖形工作站/服務(wù)器
我們有可能買到有2個(gè)、4個(gè)、8個(gè)內(nèi)存通道的單 CPU 電腦。不同通道之間的切換也代表了不同級別的處理器之間的切換,而且僅憑硬件規(guī)格很難比較它們之間的性能。如果你經(jīng)常求解非常大的模型或多個(gè)模型的并行問題,那么超過四個(gè)通道是有必要的。
(3)硬盤 固態(tài)卡(PCIe 4.0 x4或PCIe 4.0 x5)做中間數(shù)據(jù)交換盤
當(dāng)所使用的虛擬內(nèi)存明顯大于物理 RAM 的時(shí)候,用固態(tài)卡硬盤很重要。與固態(tài)存儲(chǔ)器相比,具有旋轉(zhuǎn)盤和移動(dòng)讀寫頭的機(jī)械硬盤(HDD)所需的求解時(shí)間較長。另外固態(tài)卡容量越大越好,機(jī)械盤HDD通常主要用于保存模擬數(shù)據(jù)。
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