比傳統(tǒng)處理器快140倍,NVIDIA大幅提升醫(yī)療研究速度
GeForce GPU(圖形處理器)運(yùn)行Folding@home蛋白質(zhì)模擬的速度斯坦福大學(xué)分布式計(jì)算項(xiàng)目Folding@home通過(guò)將數(shù)百萬(wàn)顆處理器的強(qiáng)大計(jì)算性能應(yīng)用在其蛋白質(zhì)折疊模擬工作中,成為從事研究癌癥、囊腫性纖維化以及帕金森綜合癥等致命疾病治療手段隊(duì)伍中的一支重要力量。Folding@home項(xiàng)目是GPU(圖形處理器)越來(lái)越多地應(yīng)用于非游戲領(lǐng)域的一個(gè)最新例子。在NVIDIA GeForce GPU(圖形處理器)上運(yùn)行Folding@home客戶端的實(shí)際結(jié)果表明,蛋白質(zhì)折疊模擬工作的速度比當(dāng)今的CPU快140倍。
斯坦福大學(xué)化學(xué)系副教授兼Folding@home項(xiàng)目總監(jiān)Vijay Pande表示:“GeForce GPU(圖形處理器)對(duì)蛋白質(zhì)折疊模擬的影響是巨大而深遠(yuǎn)的。使用GeForce GPU(圖形處理器)來(lái)模擬蛋白質(zhì)折疊的團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了其生產(chǎn)效率的極速飆升。在Folding@home中應(yīng)用如此強(qiáng)大的處理性能徹底改變了這一項(xiàng)目,極大地縮短了我們進(jìn)行生物醫(yī)學(xué)研究所需的時(shí)間。”
為了處理盡可能多的數(shù)據(jù),Folding@home項(xiàng)目聚集了大量組隊(duì)競(jìng)賽的計(jì)算機(jī)發(fā)燒友。ExtremeOverclocking.com網(wǎng)站統(tǒng)計(jì)并顯示了這些團(tuán)隊(duì)的非官方統(tǒng)計(jì)數(shù)字。NVIDIA(英偉達(dá))內(nèi)部折疊模擬團(tuán)隊(duì)僅用了10臺(tái)機(jī)器、花了兩周時(shí)間就超越了90%的團(tuán)隊(duì)。NVIDIA(英偉達(dá))團(tuán)隊(duì)添置了更多GPU(圖形處理器)之后,就全時(shí)生產(chǎn)效率而言,該團(tuán)隊(duì)在不到一個(gè)月的時(shí)間內(nèi)就躋身于僅占總數(shù)0.1%的頂級(jí)團(tuán)隊(duì)行列。
其他蛋白質(zhì)折疊團(tuán)隊(duì)在使用了NVIDIA Folding@home客戶端后也實(shí)現(xiàn)了其排名的提升。
《PC Games Hardware》編輯Carsten Spille表示:在許多隊(duì)員安裝了NVIDIA Folding客戶端之后,我們PC Games Hardware蛋白質(zhì)折疊團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了在同樣時(shí)間內(nèi)的工作量翻倍。我們每天都能超越許多團(tuán)隊(duì),最終實(shí)現(xiàn)了我們躋身世界折疊團(tuán)隊(duì)100強(qiáng)的目標(biāo)。”
蛋白質(zhì)折疊
蛋白質(zhì)可以通過(guò)一種方法聚集起來(lái),而這種方法就是生物學(xué)家所謂的“折疊”。Folding@home項(xiàng)目的目標(biāo)是了解蛋白質(zhì)折疊、誤折疊以及相關(guān)的疾病。Folding@home模擬蛋白質(zhì)折疊就是為了了解蛋白質(zhì)如何快速可靠地折疊以及蛋白質(zhì)不正確折疊的后果。阿耳茨海默氏病、囊腫性纖維化、瘋牛?。˙SE)、遺傳肺氣腫以及多種癌癥等疾病均被認(rèn)為是由蛋白質(zhì)誤折疊所造成。